r语言绘制facet violin plot小提琴刻面图实现示例-kb88凯时官网登录

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时间:2023-05-18
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老铁们,许久未见啦。顺便说一下,最近可不是小仙同学偷懒哟,电脑上个月送修今天刚刚拿回来(想买联想yoga的同学先问问自己会不会拆电脑换排线,我买的这台用了一个月,送修也用了一个月 )。
最近我可攒了个大招呢,先来看看下面这张图,有没有很眼熟呢?

这张图在开始介绍r语言的时候就出现过啦,不过小仙同学当时并不知道怎么画。今天可以秀一把啦。

step1. 绘图数据的准备

老样子,准备好要作图的csv文件。
数据的格式如下图:列表示一种变量(特征),第一行是列名
a1~a9表示9种基因,typea~typec表示三种不同的细胞

step2. 绘图数据的读取

data<-read.csv(“your file path”, header = t)    #注释:header=t表示数据中      
                                的第一行是列名,如果没有列名就用header=f

step3.绘图所需package的安装、调用

#注释:大家要注意今天要用的package安装比较特别哟
install.packages("devtools")                  
library(devtools) 
install_github("kassambara/easyggplot2")
library(easyggplot2)
#注释:今天还要用到一个新的函数,reshape2里的melt函数,可以把宽数据变成长数据 
install.package("reshape2")  
library(reshape2)
df<-melt(data,id.vars = c("type"))

step4. 绘图

ggplot2.violinplot(data=df,xname='variable',yname='value',         #注释:xname表示x轴变量,yname表示y轴变量
                   groupname='variable', legendposition="top",
                   faceting=true,facetingvarnames="type")

step5.美化

ggplot2.violinplot(data=df,xname='variable',yname='value',
                   groupname='variable', legendposition="top",
                   backgroundcolor="white",
                   removepanelgrid=true,
                   axisline=c(0.5, "solid", "black"),
                   faceting=true, facetingvarnames="type")

ps:如果想去掉边框可以加上这一句removepanelborder=true

到这里已经可以完成facet violin plot了,那么问题来了,怎么才能让图片变成下图这个样子呢?小仙同学用了个很笨的方法,下次分享揭晓答案哟!

以上就是r语言绘制facet violin plot小提琴刻面图实现示例的详细内容,更多关于r语言绘制facet violin plot小提琴刻面图的资料请关注其它相关文章!

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